Hybridization REF	TCGA-09-0364-01A-02R-0363-07	TCGA-09-0366-01A-01R-0363-07	TCGA-09-0367-01A-01R-0363-07	TCGA-09-0369-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0714-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0717-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0723-01A-02R-0363-07	TCGA-13-0724-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0725-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0726-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0727-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0730-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0757-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0760-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0761-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0762-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0764-01A-03R-0363-07	TCGA-13-0768-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0791-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0792-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0793-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0794-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0795-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0800-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0801-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0802-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0803-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0804-01A-01R-0363-07	TCGA-13-0805-01A-01R-0363-07
Composite Element REF	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol	log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol
ELMO2	-0.024	0.0320625	0.1259375	-0.00131249999999999	0.027625	0.2503125	0.0853125	-0.1675	0.012625	-0.058125	0.652875	0.85875	0.34075	-0.227875	-0.1080625	0.18225	-0.0240625	-0.2280625	-0.1714375	-0.149	-0.3191875	0.719375	-0.19775	0.269875	-0.139375	-0.137875	-0.1409375	-0.31875	0.0264375
CREB3L1	0.158333333333333	-0.7455	-0.542833333333333	0.6265	1.01	0.036	0.116833333333333	0.348	0.316666666666667	0.4435	0.527666666666667	0.530333333333333	0.243166666666667	-0.115666666666667	0.3765	0.394333333333333	0.031	0.991333333333333	0.4015	0.214166666666667	1.71083333333333	-0.26	0.478166666666667	0.171333333333333	0.392166666666667	0.279	0.9735	-0.569833333333333	0.688333333333333
RPS11	1.2025	-0.8238	1.4367	0.6141	0.989	1.559	0.00070000000000001	1.059	0.1502	-0.5188	1.3998	0.195	1.0876	0.189	0.4966	0.0979	0.6081	-0.1375	1.0541	1.0619	1.102	1.0599	0.916	0.2691	0.9779	1.0244	1.5694	0.3768	0.9865
PNMA1	1.8598	0.5228	0.027	1.1264	0.4042	0.3362	0.2138	0.515	1.06	-0.4812	1.037	0.4312	-0.2632	-0.356	0.4342	2.4832	0.7214	0.7016	-0.3774	-0.2522	1.2726	0.6682	-0.5794	1.496	-0.324	1.119	0.3572	-0.0548	0.1732
MMP2	-1.358625	-1.043625	-1.505	-0.318	0.1125	-1.226875	-1.17425	-0.345	-0.53875	-0.31075	-1.010125	-0.1545	0.161125	-1.241625	-0.39225	-0.58625	-1.24175	0.95025	-1.439125	-1.492125	-0.00750000000000003	-1.62025	-0.812	-1.3395	-1.3295	-0.593375	-0.946375	-1.157125	-0.0735
C10orf90	-1.9776	-2.0164	-1.9174	-2.142	-1.6948	-2.0088	-2.0294	-1.8742	-2.1074	-1.8632	-1.7096	-1.3372	-1.8476	-1.8982	-1.6154	-1.6968	-1.9492	-1.8422	-1.3868	-1.5724	-1.3442	-1.9136	-1.7126	-1.764	-1.5722	-1.8666	-1.4672	-1.7808	-1.8434
ZHX3	-0.969875	-1.1335	-0.707875	-0.504875	-0.557875	0.039875	-0.637	-0.38825	-0.49975	-0.795125	-0.260125	0.3515	0.04725	-0.3485	-0.847125	-0.229875	-1.41125	0.212875	-0.62475	-1.10425	-0.145	-0.359125	0.155	-0.457375	-0.8925	-0.996125	0.086125	-0.16675	-0.17
ERCC5	1.3554	-0.0422	0.2684	-0.0748	0.632	-0.345	0.1636	0.3164	-0.1952	0.4882	0.5566	0.6024	-0.205	0.483	0.4084	0.391	-0.4112	0.4212	-0.0448	-1.2252	0.3008	0.1128	0.146	-0.3626	0.0602	0.5402	1.3524	0.1716	-0.1106
GPR98	-1.1735	-1.54827272727273	-1.72127272727273	-0.0383	-0.830666666666667	-0.049909090909091	-1.5365	-1.71954545454545	-1.28572727272727	-1.25475	-1.46254545454545	-0.383916666666667	-0.4055	-1.81772727272727	-1.69209090909091	-0.4163	-2.13658333333333	-2.1153	-1.16881818181818	-1.42955555555556	-1.248	-0.966818181818182	-1.28008333333333	-1.27383333333333	-1.68375	-0.693	-1.54254545454545	-0.695181818181818	-2.048
RXFP3	0.288666666666667	-0.250333333333333	0.307666666666667	-0.0373333333333333	0.503333333333333	0.193	0.16	0.305	-0.271666666666667	0.26	0.203333333333333	0.0433333333333333	0.414	0.0646666666666667	0.366	0.279666666666667	0.422	0.148	0.732	0.085	0.839666666666667	0.175	0.498	0.06	0.104333333333333	0.172333333333333	0.725666666666667	0.195666666666667	0.496666666666667
APBB2	0.3592	-0.407	0.307	1.3324	0.8572	-0.3656	-0.568	0.876	0.9266	-0.4016	-1.3444	1.9532	0.4302	-0.321	-0.366	0.6972	-0.0608	0.654	-0.1772	-0.5062	-0.5168	-0.8482	0.6446	0.2634	-2.4268	0.779	-0.0066	0.6462	-0.4094
PRO0478	-0.803	-0.113727272727273	-1.489	-0.698909090909091	-0.460636363636364	-0.306181818181818	-0.425181818181818	0.212909090909091	-0.354	-0.0573636363636364	-0.269636363636364	-0.259454545454545	-0.981636363636364	-0.654636363636364	-1.19690909090909	0.355090909090909	-0.724636363636364	0.163	-0.734181818181818	-1.02572727272727	-0.138363636363636	-0.771272727272727	-0.341818181818182	-0.875363636363636	-1.24745454545455	-1.30718181818182	-0.00254545454545451	0.0697272727272727	-0.994818181818182
KLHL13	-1.4982	0.4094	-0.032	-0.5808	-3.254	-3.4414	-1.3204	-2.8192	-2.142	-2.6796	-3.1118	0.743	-1.2432	-3.555	-1.5972	-2.8848	-3.4722	-1.298	-1.3728	-2.6212	-3.1312	-3.3692	-3.4066	-1.5112	-2.616	-1.3968	-3.0768	-3.6732	-3.1786
PRSSL1	-0.589375	-0.768	-0.20425	-0.7295	-0.0211250000000001	-0.593625	-0.4485	-0.507	-0.837125	-0.172	-0.30475	-0.91025	0.275	-0.12575	-0.520875	-0.540625	-0.150875	-0.304375	0.08325	0.043875	-0.0873749999999999	-0.190875	-0.0708750000000001	-0.57575	0.0925	-0.68375	-0.278	0.83375	0.8365
PDCL3	0.2235	0.5305	-0.290625	0.207	0.15475	-0.2575	0.728625	0.2265	-0.60025	0.2485	0.194375	0.33525	0.05325	-0.37475	0.479625	-0.36325	-0.0665	0.940375	0.388	0.39375	0.13575	0.335875	-0.5425	1.53175	0.383875	-0.0465	-0.345375	-0.031125	0.206625
DECR1	-0.9351	-0.6678	-0.9458	-0.3532	-0.5243	-2.2445	-1.6311	-1.0191	0.0445	-0.0231	-1.7662	-0.6486	-1.2077	-0.553	-0.1217	-2.923	-0.7568	-0.5553	-0.9182	-0.7797	-1.1805	-0.6052	-2.1331	-0.3532	-0.2608	-0.4301	-1.4863	-1.3739	-0.4444
SALL1	-0.19425	-3.380625	-5.07575	-4.556375	-4.27675	-2.533	-2.920125	-4.89875	-4.167625	-3.465	-4.48825	1.19225	-1.2155	-4.353	-3.479625	-4.350625	-4.88428571428571	-4.5045	-4.008	-4.25657142857143	-3.82525	-3.128875	-3.36775	0.975375	-4.5365	0.9265	-4.57585714285714	-4.2135	-4.588125
CADM4	0.789125	0.070375	0.27025	1.286625	0.458125	0.747625	-0.0435	-0.204375	0.48175	0.38175	0.233625	0.77175	1.26525	-0.19475	0.683875	0.452875	0.463	-0.288375	0.449125	-0.017625	0.349375	0.402625	0.095	0.460125	0.998875	0.99125	0.408	-0.2845	0.664875
RPS18	1.41647368421053	-0.130631578947368	1.32542105263158	-0.46	0.757789473684211	1.21794736842105	0.296052631578947	1.61289473684211	-0.217736842105263	-0.839105263157895	0.990052631578947	-0.197157894736842	1.34778947368421	0.353421052631579	1.22368421052632	1.02457894736842	1.45778947368421	-0.108157894736842	1.01263157894737	2.24463157894737	1.336	0.931894736842105	1.45489473684211	0.894263157894737	0.589789473684211	0.199842105263158	0.88078947368421	0.722736842105263	1.54578947368421
HNRPD	-0.115866666666667	-1.0262	-0.832666666666667	-0.339	-1.3864	-1.62793333333333	-0.372533333333333	-1.1964	-0.326666666666667	-1.3198	-0.837666666666667	-0.561333333333333	-1.34513333333333	-0.730066666666667	-0.605066666666667	-2.051	-1.0536	-1.21673333333333	-1.28333333333333	-1.9958	-2.0562	-0.562666666666667	-1.88086666666667	-0.388266666666667	-1.01006666666667	0.00686666666666666	-1.9712	-1.34433333333333	-1.58953333333333
CFHR5	0.776833333333333	0.22925	0.108	-0.337571428571429	0.029	0.183333333333333	0.609833333333333	-0.1135	0.330166666666667	0.155571428571429	-0.00737499999999998	0.00385714285714286	-0.238375	0.206857142857143	0.238375	-0.5265	1.70957142857143	-0.298571428571429	0.398875	-0.2605	0.172875	0.457	-1.456875	0.385333333333333	-0.761875	-0.08925	0.438	0.179625	-0.229625
SLC10A7	-0.277	-0.478272727272727	-0.259090909090909	0.220636363636364	-0.329818181818182	-1.14327272727273	-0.371181818181818	-0.457454545454545	-0.678090909090909	-0.124636363636364	-0.651363636363636	-0.648181818181818	-0.517272727272727	-0.0720909090909091	-0.221545454545455	-0.854181818181818	-0.293363636363636	-0.619363636363636	0.257818181818182	-0.538	-0.785818181818182	0.116454545454545	-0.688090909090909	-0.545818181818182	-0.126363636363636	-0.3	-0.667636363636364	-0.484	-0.867363636363636
OR2K2	0.660333333333333	0.767333333333333	0.766666666666667	-0.180333333333333	0.743666666666667	1.154	-0.0276666666666667	0.630333333333333	0.361	0.525666666666667	0.450666666666667	0.286	0.424666666666667	0.268333333333333	0.700333333333333	0.619333333333333	0.172333333333333	0.043	0.384333333333333	0.608333333333333	0.310666666666667	0.847	0.482	0.355333333333333	0.549333333333333	0.393333333333333	0.895666666666667	0.358333333333333	0.8
LMAN1	-1.45545454545455	-0.512090909090909	-1.07172727272727	-0.569363636363636	-1.237	-0.991090909090909	-0.861	-1.50718181818182	-0.770272727272727	-1.71	-2.17027272727273	-1.40672727272727	-0.755545454545455	-0.412181818181818	-0.693	-0.413	-0.914818181818182	-0.935545454545454	-1.66527272727273	-1.20845454545455	-1.57054545454545	-0.645636363636364	-1.67981818181818	-1.73118181818182	-0.850272727272727	-1.10763636363636	-1.87627272727273	-1.61736363636364	-1.48245454545455
SUHW1	-1.2578	-1.8374	-2.1272	-2.0092	-1.4982	-1.3346	-1.5178	-1.5032	-2.5788	-2.4834	-1.8364	-1.5364	-0.9064	-0.4784	-1.3592	-1.6086	-1.31	-1.6608	-1.891	-2.3352	-1.7448	-1.544	-1.6588	-1.4322	-1.189	-1.1344	-1.9182	-2.3372	-1.422
CHD8	0.294769230769231	-0.217615384615385	-0.283846153846154	-0.467692307692308	0.0705384615384615	-0.643923076923077	-0.796769230769231	0.0506153846153846	-0.564461538461538	-0.930076923076923	-0.608769230769231	1.15061538461538	-0.967538461538461	0.392846153846154	-0.506	0.360846153846154	-0.259461538461538	0.445769230769231	-0.527923076923077	-0.636153846153846	0.136	-0.422615384615385	-0.240692307692308	0.119615384615385	-0.440461538461538	-0.208153846153846	0.226461538461538	0.172	0.112923076923077
SUMO1	0.609923076923077	0.348	0.470384615384615	0.316615384615385	0.225692307692308	-0.282153846153846	0.186538461538462	0.468153846153846	0.691846153846154	0.982615384615385	0.485384615384615	0.817307692307692	0.733307692307692	0.740307692307692	0.764615384615385	0.149230769230769	0.170692307692308	0.602692307692308	1.21630769230769	0.277076923076923	1.496	0.191384615384615	0.0610769230769231	1.15253846153846	0.480153846153846	0.688384615384615	0.644230769230769	0.119769230769231	0.800615384615384
GP1BA	0.208076923076923	0.117	0.421923076923077	0.388769230769231	0.406	0.296538461538462	0.562230769230769	0.219384615384615	0.221769230769231	0.138076923076923	0.14	0.0844615384615384	0.220384615384615	0.395307692307692	0.319461538461539	0.226846153846154	0.422384615384615	0.411461538461538	0.208384615384615	0.387692307692308	0.300153846153846	0.00146153846153846	0.174769230769231	0.0271538461538462	0.376615384615385	0.196615384615385	0.426230769230769	0.109	0.168230769230769